Variants rares

VIH-2 :

 Du fait du pouvoir pathogène plus faible du VIH de type 2 comparé à celui du VIH-1, l’infection à VIH-2 se caractérise par une progression clinique lente, une moindre transmissibilité, un maintien prolongé des lymphocytes CD4 et une détection d’ARN viral plasmatique positive chez seulement environ la moitié des patients et à des titres faibles. En France, environ 2% des patients infectés par le VIH sont porteurs du VIH-2, et environ 0.1% sont co-infectés (VIH-1 et VIH-2). Le pouvoir pathogène plus faible du VIH-2 et sa sensibilité différente aux antirétroviraux justifient de réaliser un typage sérologique spécifique lors de la découverte d’une séropositivité VIH.

Afin de mieux comprendre l'infection à VIH-2, une cohorte nationale prospective multicentrique a été mise en place en France sous l’égide de l’ANRS depuis 1994. Au 31/12/2012, cette cohorte est composée d’environ 900 patients pour lesquels une biothèque (cellulothèque et plasmathèque) est réalisée tous les 6 mois. Des études virologiques et immunologiques satellites y sont menées, permettant de préciser les mécanismes de résistance et les facteurs prédictifs de la progression clinique.

Les tests commercialisés de détermination de la charge virale plasmatique du VIH ne sont pas adaptés au VIH-2. Le laboratoire associé de l’hôpital Bichat-Claude Bernard a développé des tests spécifiques de mesure de la charge virale VIH-2 et peut donc être sollicité pour réaliser cet examen (cf tableau des tests réalisés au CNR du VIH).

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VIH-1 non-M : les groupes N, O, P. 

Alors que l'émergence de ces variants résulte d’évènements de transmission inter-espèces en Afrique, la circulation de ces virus n'a pas de frontières, puisque chacun d’entre eux a été détecté en France. On estime qu’environ 0.1% des patients infectés par le VIH sont porteurs du VIH-1 groupe O dans notre pays. Les variants de groupes N et P sont encore plus rares. L’ensemble de ces variants possèdent des caractéristiques antigéniques et moléculaires distinctes des virus pandémiques du groupe M, qui peuvent être à l’origine de difficultés diagnostiques, et/ou de difficultés du suivi virologique et de prise en charge thérapeutique. Bien que les tests commerciaux actuels de détermination de la charge virale plasmatique couvrent la majeure partie de la diversité génétique des VIH-1, la vigilance doit être maintenue, en particulier lors de discordances immuno-virologiques, ou lors de résultats incohérents entre le diagnostic sérologique et le suivi virologique (charge virale indétectable chez un patient naïf de traitement, ou échec lors de l’amplification génique des régions cibles des antirétroviraux).

Il n’existe pas de tests commerciaux de typage sérologique de l’infection par les VIH-1 non-M. Des outils spécifiques ont été développés par le CNR du VIH. Les différents laboratoires du CNR peuvent être sollicités pour réaliser cet examen (cf tableau des tests réalisés au CNR du VIH). A signaler que le typage sérologique spécifique est effectué systématiquement par le CNR (laboratoire associé, CHU de Tours) dans le cadre de la surveillance virologique liée à la déclaration obligatoire (DO) de séropositivité VIH, et que l’information d’infection par un variant rare est alors signalée au laboratoire ayant fait la DO.

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