CNR VIH - surveillance et caractérisation des virus récemment transmis

surveillance et caractérisation des virus récemment transmis (virus identifiés lors de primo-infections ou séroconversions très récentes).

Une surveillance annuelle de la transmission de virus résistants aux antirétroviraux a été instaurée en France sous l’égide de l’ANRS depuis 1996. ML Chaix (laboratoire associé, Hôpital St Louis) coordonne la surveillance de la résistance transmise en colligeant les données issues d’une part de la cohorte PRIMO ANRS CO06 et d’autre part des laboratoires de virologie du réseau AC11-ANRS où les virologues identifient les patients au moment de leur primoinfection VIH mais non inclus dans la cohorte. Tous les patients sont inclus dans les 6 mois suivant leur contamination. En parallèle à la surveillance de la résistance transmise, les données contribuent à la surveillance épidémiologique des virus isolés au moment de la primo-infection en terme de diversité génétique et de foyers de transmission (clusters).

Pour inclure des patients dans cette surveillance, il est nécessaire de s’assurer que la primoinfection VIH-1 date de moins de 6 mois (antécédent de sérologie négative datant de moins de 6 mois ou ARN VIH positif isolé, ou profil de western blot incomplet).

Pour chaque patient, une fiche clinique (cf modèle ci-joint) est à remplir et un fichier de séquences nucléotidiques et acides aminés de l’ensemble des gènes (RT, protéase, intégrase, gp120) doit être fait. L’ensemble (fiche clinique et fichier de séquences) doit être envoyé à Maria-Laure Chaix (marie-laure.chaix@sls.aphp.fr).

Bibliographie

  • Chaix ML et coll. Stable frequency of HIV-1 transmitted drug résistance in patients at the time of primary infection over 1996-2006 in France. AIDS 2009, 23 : 717-724.
  • Chaix ML et coll. Increasing HIV-1 non-B subtype primary infections in patients in France and effect of HIV subtypes on virological and immunological responses to combined antirétroviral therapy. Clin Infect Dis 2013, 56(6) : 880-887.
  • Frange P et coll. Recent HIV-1 infection contributes to the viral diffusion over the French territory with a récent increasing frequency. PLoS One 2012, 7(2) : e31695.

 

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